棗銹病主要為害葉片，有時也侵害果實。發病初期，葉片背面多在中脈兩側及葉片尖端和基部散生淡綠色小點，漸形成暗黃褐色突起，即銹病菌的夏孢子堆。夏孢子堆埋生在表皮下，后期破裂，散放出黃色粉狀物，即夏孢子。發展到后期，在葉正面與夏孢子堆相對的位置，出現綠色小點，使葉面呈現花葉狀。病葉漸變灰黃色，失去光澤，干枯脫落。樹冠下部先落葉，逐漸向樹冠上部發展。在落葉上有時形成冬孢子堆，黑褐色，稍突起，但不突破表皮。